Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sf3b2Q3UJB0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms