Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccndbp1Q3TVC7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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