Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Shcbp1lQ3TTP0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms