Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pnpla6Q3TRM4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Pnpla6Q3TRM4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms