Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Spatc1Q148B6 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms