Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps8Q0P5W1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps8Q0P5W1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms