Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Cib3Q0P523 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms