Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cacna1cQ01815 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms