Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cited1P97769 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms