Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Tubg1P83887 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Tubg1P83887 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms