Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRB1P82279 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRB1P82279 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRB1P82279 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRB1P82279 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms