Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Irx1P81068 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Irx1P81068 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Irx1P81068 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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