Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LtbrP50284 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LtbrP50284 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtbrP50284 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LtbrP50284 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LtbrP50284 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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LtbrP50284 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LtbrP50284 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LtbrP50284 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LtbrP50284 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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LtbrP50284 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LtbrP50284 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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