Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Elk1P41969 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Elk1P41969 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Elk1P41969 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Elk1P41969 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Elk1P41969 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Elk1P41969 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Elk1P41969 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Elk1P41969 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Elk1P41969 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms