Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PpargP37238 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PpargP37238 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PpargP37238 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PpargP37238 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PpargP37238 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PpargP37238 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PpargP37238 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PpargP37238 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms