Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms