Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Pou2f1P25425 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms