Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TP20293 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TP20293 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TP20293 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TP20293 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TP20293 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TP20293 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TP20293 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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TP20293 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TP20293 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TP20293 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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