Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxb1P17919 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms