Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Myod1P10085 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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