Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01667 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P01667 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01667 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms