Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127 ms