Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Foxq1O70220 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Foxq1O70220 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Foxq1O70220 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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