Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Opn1mwO35599 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms