Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Clk2O35491 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Clk2O35491 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Clk2O35491 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
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