Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casq1O09165 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Casq1O09165 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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