Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms