Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim22J3QP37 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms