Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E030018B13RikJ3QMS9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms