Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm21060J3KMU4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm21060J3KMU4 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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