Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Smim1-202ENSMUST00000126119 3996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gdpd1-201ENSMUST00000020804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm38043-201ENSMUST00000195501 5141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ercc6-201ENSMUST00000066807 8423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 EPPK1-201ENSMUST00000226781 12325 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 2410021H03Rik-201ENSMUST00000187090 764 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pard3b-201ENSMUST00000046673 3426 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Zfp846-202ENSMUST00000115557 12974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Pkib-202ENSMUST00000075992 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cpa4-201ENSMUST00000049251 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 A330049N07Rik-203ENSMUST00000220010 1989 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gcm1-201ENSMUST00000024104 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Eif2ak4-205ENSMUST00000110872 4907 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Osgepl1-202ENSMUST00000114484 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Osbpl3-201ENSMUST00000071728 3307 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Chid1-209ENSMUST00000166082 4222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Gm20538F6Z9R1 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms