Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Myo5cE9Q1F5 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Myo5cE9Q1F5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms