Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Brd1E9PZ26 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms