Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprbB2RU80 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms