Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms