Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Odf2A3KGV1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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