Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Gm6880A3KG45 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm6880A3KG45 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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