Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms