Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Scn3aA2ASI5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Scn3aA2ASI5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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