Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mbd3Q9Z2D8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms