Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Cldn6Q9Z262 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn6Q9Z262 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn6Q9Z262 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn6Q9Z262 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn6Q9Z262 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn6Q9Z262 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn6Q9Z262 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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