Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Gpc6Q9R087 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gpc6Q9R087 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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