Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ChmQ9QXG2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms