Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Homer2Q9QWW1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms