Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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SrfQ9JM73 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SrfQ9JM73 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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