Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FancaQ9JL70 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FancaQ9JL70 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms