Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Mrpl39Q9JKF7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms