Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ap3m1Q9JKC8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms