Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lmbr1Q9JIT0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lmbr1Q9JIT0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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