Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp29Q9ES63 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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